ฝ่ายบริหารกลยุทธ์ เป็นหน่วยงานที่รับผิดชอบงานด้านกลยุทธ์ของสถาบันฯ โดยการวางแผนกลยุทธ์ของสถาบันฯ ร่วมกับผู้บริหารและฝ่ายต่างๆ และผลักดันให้มีการนำกลยุทธ์ของสถาบันฯ ไปปฏิบัติทั่วทั้งองค์กรเพื่อให้บรรลุวัตถุประสงค์เชิงกลยุทธ์ รวมทั้งการบริหารความเสี่ยงเชิงกลยุทธ์ ตลอดจนการสื่อสารกลยุทธ์ของสถาบันฯ ทั้งภายในและภายนอก และการบริหารการประชุมคณะกรรมการสถาบันฯ ประกอบด้วย

1. แผนกวางแผนกลยุทธ์: รับผิดชอบงานด้านการวางแผนกลยุทธ์และการบริหารความเสี่ยงของสถาบันฯ
2. แผนกบริหารและสื่อสารกลยุทธ์: รับผิดชอบงานด้านการบริหารการดำเนินกลยุทธ์ของสถาบันฯ ให้ประสบความสำเร็จ และสื่อสารกลยุทธ์ของสถาบันฯ
3. แผนกบริหารการประชุม: รับผิดชอบงานด้านการประชุมคณะกรรมการสถาบันฯ